Η υπόθεση της λεγόμενης «Μαφίας της Κρήτης», όπως ήρθε στο φως μέσα από αποκαλύψεις τηλεφωνικών συνομιλιών, δεν φέρνει μόνο στο προσκήνιο φαινόμενα διαφθοράς και διαπλοκής στους κόλπους της Εκκλησίας. Αποκαλύπτει και τον κομβικό ρόλο που φέρεται να είχε η ίδια η κυβέρνηση σε σειρά εκκλησιαστικών εξελίξεων στην Κρήτη.
Σύμφωνα με όσα η ιστοσελίδα powergame.gr φέρνει στο προσκήνιο, ο Κυριάκος Μητσοτάκης είχε εμπλακεί ενεργά στην επιλογή του νέου Αρχιεπισκόπου Κρήτης, αποκλείοντας τον μητροπολίτη Κισάμου και Σελίνου Αμφιλόχιο. Έναν εκ των βασικών διεκδικητών του “θρόνου”. Αντίθετα, στήριξε την υποψηφιότητα του νυν Αρχιεπισκόπου Ευγένιου, επηρεασμένος, όπως λέγεται, από κύκλους της Μονής Αγίας Τριάδας.
Αυτή η προσωπική παρέμβαση είχε συνέπειες που φτάνουν ως το σήμερα. Όταν, μετά τον θάνατο του μητροπολίτη Χανίων, ετέθη θέμα μετάθεσης του Αμφιλοχίου στη συγκεκριμένη Μητρόπολη, ο πρωθυπουργός φέρεται να επανέλαβε το “βέτο” του, μπλοκάροντας τη διαδικασία ακόμα και μέσω νομοθετικής ρύθμισης που απαγόρευσε τις μετακινήσεις μητροπολιτών. Το γεγονός αυτό δείχνει πως το Μέγαρο Μαξίμου δεν έμεινε απλός παρατηρητής των εκκλησιαστικών πραγμάτων, αλλά λειτούργησε ως ρυθμιστικός παράγοντας, με θεσμικό “βάρος”.